Navarrabiomed en colaboración con la Universidad de Navarra organiza el curso en interpretación y gestión de información genómica "Introducción al análisis de datos ómicos: transcriptómica", organizado en el marco de IRIS Navarra, Polo de Innovación Digital y del proyecto europeo IRIS EDIH.
Fecha: 30 y 31 de mayo de 2024
Duración: 12 horas (2 días con 6 horas/día en horario de 9:00 a 15:00 h)
Modalidad: presencial*
Plazas: máximo 25 participantes**
Entidades organizadoras: Navarrabiomed y UNAV
* La asistencia presencial es un requisito imprescindible para obtener el certificado.
** Si tras inscribirse no puede acudir al curso, se solicita que lo notifique lo antes posible para que otra persona pueda ocupar su lugar. Las vacantes disponibles se asignarán siguiendo el orden de inscripción.
Objetivo:
Este curso proporcionará una comprensión básica del análisis de datos ómicos, a través del caso concreto de la transcriptómica. Los participantes adquirirán habilidades para procesar, analizar e interpretar este tipo de datos mediante el uso de herramientas bioinformáticas y técnicas estadísticas.
Descripción:
Dentro del campo de la genómica, la transcriptómica estudia el ARN con el fin de comprender la expresión y regulación génica. Esto permite identificar biomarcadores y mecanismos moleculares implicados en procesos biológicos, como la respuesta inmune, la progresión a enfermedades como el cáncer y la respuesta a tratamientos farmacológicos. Por tanto, la transcriptómica es una herramienta de gran utilidad en la investigación biomédica y la medicina personalizada, así como en el desarrollo de nuevas terapias y productos biotecnológicos en el ámbito empresarial. Por ello, entender sus principios y aplicaciones es esencial para profesionales en estos campos.
En este contexto, el curso “Introducción al análisis de datos ómicos: transcriptómica” ofrece una visión general de la transcriptómica, desde los fundamentos hasta las técnicas de análisis y la exploración de los resultados mediante técnicas bioinformáticas y estadísticas. Para ello, se realizarán sesiones teóricas y prácticas empleando RStudio, una interfaz de desarrollo integrada (IDE) ampliamente utilizada para trabajar con el lenguaje de programación R.
Al finalizar el curso, los participantes tendrán las herramientas necesarias para comenzar a trabajar con datos transcriptómicos y extraer información relevante de ellos.
Contenido del curso:
• Introducción a la transcriptómica.
• Fundamentos del diseño experimental.
• Formatos de archivos de RNA-seq.
• Análisis de los datos: control de calidad, mapeo y conteo de las lecturas.
• Análisis estadístico de la diferencia de expresión.
• Exploración y visualización de resultados (anotación de categorías funcionales y análisis de enriquecimiento).
• Repositorios de datos abiertos para RNA-seq.
Dentro del ciclo formativo “Curso en interpretación y gestión de información genómica”, se incluyen los cursos “Análisis de datos con R: Introducción y estadística básica” (3 días) e “Introducción al análisis de datos ómicos: transcriptómica” (2 días). Aunque se pueden realizar de forma independiente, se recomienda la participación en ambos para aquellos interesados en los análisis ómicos que no tengan conocimientos previos en R y estadística.
Los participantes deberán traer su propio ordenador con los programas R y RStudio instalados. Se pueden descargar gratuitamente desde https://cran.r-project.org/ y https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/. Si necesita ayuda para instalar R y/o RStudio en su ordenador, póngase en contacto con la organización.
La participación al curso es gratuita previa inscripción.
Se asignarán las plazas por orden de inscripción hasta completar aforo (25 plazas).